在许多国家，由于药物敏感性表型检测的局限性，定期监测抗结核药物耐药性的形成会受到限制。2018年6月的《The Lancet. Infectious diseases》刊载了一项研究，旨在评估基因测序法在抗结核病药物耐药性监测上的应用。
该研究在7个国家（阿塞拜疆、孟加拉国、白俄罗斯、巴基斯坦、菲律宾、南非和乌克兰）的医院和诊所中开展，用基因测序的方法评估分离出的结核杆菌对利福平、异烟肼、氧氟沙星、莫西沙星、吡嗪酰胺、卡那霉素、阿米卡星和卷曲霉素的耐药性。对每种药物，通过比较校正后的耐药性发生率（通过基因测序法确定）和真正的耐药性发生率（通过表型测试确定），来评估基因测序法的准确性。
2009年11月至2014年5月期间，共招募7094名结核病患者参与研究，从这些受试者身上分离出结核杆菌。在所有结核病病例中，通过基因测序法预测耐药性发生率的敏感度分别为：rpoB基因，91%（95%CI，87-94）（对利福平的抗药性）；katG基因、inhA基因和fabG启动子基因合并结果，86%（74-93）（对异烟肼的抗药性）；pncA基因，54%（39-68）（对吡嗪酰胺的抗药性）；gyrA和gyrB基因合并结果，85%（77-91）（对氧氟沙星的抗药性）；gyrA和gyrB基因合并结果，88%（81-92）（对莫西沙星的抗药性）。对几乎所有药物和在大多数情况下，基因测序法得出的耐药性发生率和表型测试得出的发生率有很大的重叠。
研究认为，基因序列法可作为监测耐药性的有效工具，为资源贫乏国家的抗结核药物耐药性监测工作提供新的手段。在将基因测序法广泛用于监测之前，需要将DNA提取方法、记录和报告术语以及数据解释方法标准化。
该研究由比尔及梅林达·盖茨基金会，美国国际开发署，全球结核病药物开发联盟赞助。
原文出处：Zignol M, Cabibbe AM, Dean AS, et al. Genetic sequencing for surveillance of drug resistance in tuberculosis in highly endemic countries: a multi-country population-based surveillance study[J]. Lancet Infect Dis. 2018 Jun;18(6):675-683. doi: 10.1016/S1473-3099(18)30073-2.
链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29574065