中国国内人口大规模从农村向城市流动，为结核病控制工作带来了新的挑战。2018年7月的《The Lancet. Infectious diseases》刊载了一项研究，旨在将基因组数据、空间数据和流行病学数据结合起来，描述有大量流动人口的城市环境中结核病的传播动力学特征。
研究者们针对上海松江地区的培养阳性结核分枝杆菌开展了一项基于人群的研究。采用全基因组测序法，对具有相同“数目可变串联重复序列（VNTR）”组合的结核分枝杆菌表观基因簇进行了区分，并分析了居住距离与基因学成簇的结合分枝杆菌感染风险之间的关系。最后，利用基因组学数据、空间数据和流行病学数据，估计了流动人口和本地居民之间的传播联系和感染时间。
2009年1月1日至2015年12月31日期间，共记录了1620例培养阳性肺结核病例，其中1211例（75%）发生在国内流动人口中。在具有相同VNTR组合的218人中，有150人（69%）的分离菌株位于至少一种其他菌株的10个单核苷酸多态性（SNP）之内，并与结核分枝杆菌的近期传播一致。从居住距离较近的个体受试者身上收集的成对菌株，比从居住距离较远的个体受试者身上收集的菌株在基因上相似的可能性更大——患者居住地之间每增加一公里距离，基因匹配菌株位于彼此10个SNP之内的几率会下降约10%[OR为0.89（95%CI为0.87-0.91）；p<0.0001]。研究者们推断，从本地居民到流动人口的传播和从流动人口到本地居民的传播几率是一样普遍的；基因簇感染病例中有三分之二以上的流动人口是迁移后在本地感染的。
研究者们认为，促使城市中心区结核病发病率升高的主要原因是流动人口和本地居民相互之间的本地传播。将流行病学数据、基因组学数据和空间数据结合起来分析，有助于更好地理解疾病的本地传播动态，为设计更有效的干预措施提供更多的信息。
该研究由中国国家自然科学基金、中国国家科技重大专项、美国国立卫生研究院赞助。
原文出处：Yang C, Lu L, Warren JL, et al. Internal migration and transmission dynamics of tuberculosis in Shanghai, China: an epidemiological, spatial, genomic analysis[J]. Lancet Infect Dis. 2018 Jul;18(7):788-795. doi: 10.1016/S1473-3099(18)30218-4.
链接：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/29681517