为进一步提升食品微生物风险监测工作水平，提高食源性致病菌监测溯源检测能力，12月4-5日，国家食品安全风险评估中心在北京召开了基于全基因组测序食源性致病微生物溯源技术国际研讨会。本次研讨会由北京市自然科学基金委资助，国家食品安全风险评估中心、北京市自然科学基金委、中科院微生物所、中科院病毒所、上海出入境检验检疫局、美国CDC、美国佐治亚大学、爱尔兰都柏林大学以及来自全国31省级疾控中心的微生物技术人员共40余人参加本次会议。我中心细菌所派员参会。
国家风评中心副主任李宁出席开幕式并讲话。她指出，我国食品安全已经有了较大的改善，但仍然面临诸多问题和挑战，每年大约有2亿人发生食源性疾病，由微生物引起的食源性疾病不仅是我国、也是全球食品安全面临的首要问题；全基因组测序技术已经成为国际食源性疾病暴发溯源的金标准之一，比常规鉴定方法更加快速、准确，可以为及时控制和召回病因食品、有效诊治病患提供了强有力的技术支持。她强调，要尽快建立我国基于全基因组测序的微生物基础数据库，提高测序数据的分析和利用效率，加强国际交流与合作，切实提高我国食源性疾病暴发的病原溯源能力和处置水平。
会议邀请了国内外专家分别就全基因组测序技术在食源性疾病监测中的应用前景、食源性致病菌基因组研究现状、全基因组测序数据库的构建、全基因组测序数据在耐药基因分析、血清型预测、病原归因分析等方面的应用等方面进行深入讨论。来自美国CDC John Besser教授介绍了全基因组测序技术在美国的发展应用情况，他指出美国CDC将于2019年全部采用全基因组测序技术替代现有的溯源分析技术；爱尔兰都柏林大学的séamus Fanning和Suzie Coughlan教授应用全基因组测序技术识别食品动物源大肠埃希氏菌中的耐药编码元件和研究食品中诺如病毒遗传多样性；中科院微生物所的朱宝利教授通过分析肠道微生物全基因组测序数据分析了可移动耐药基因的传播和药物耐受的机制；国家风评中心微生物部李凤琴主任通过对重金属和人畜共患致病菌的动力学关系研究以及一株携带mcr-1基因的鼠伤寒沙门氏菌全基因组数据分析，认为全基因组测序是一种诠释食品相关微生物的有用工具；刘翟教授和吴林寰介绍了介绍了我国食源性致病菌基因组研究的情况和数据平台的建设情况；邓翔宇教授介绍了美国CDC基于全基因组测序技术构建的数据库对沙门氏菌血清型进行预测及人畜共患病归因的应用情况；来自上海出入境的蒋原教授介绍了应用全基因组测序技术对中国进口乳制品进行回顾性调查研究的情况。
本次会议内容精炼，主题鲜明，通过各位专家对全基因组测序技术应用的介绍，参会人员开阔了工作思路，对基于全基因组测序食源性致病微生物溯源技术有了更加深入的认识。本次会议的顺利召开，为全基因组测序技术在我国食源性疾病监测工作中的推广和应用迈出了坚实的一步，将有力的促进全国食品微生物风险监测工作的全面开展。