一是加强组织领导。为确保新生儿疾病筛查工作顺利开展，莘县卫生计生局成立全县新生儿疾病筛查工作领导小组，局长任组长，分管副局长任副组长，相关科室负责人为成员，负责新筛工作的组织领导、实施汇总和考评工作。下发了《关于切实加强全县新生儿疾病筛查工作的通知》，将新生儿疾病筛查、听力筛查工作任务指标分解到各镇（街）党委、政府。各镇（街）、具备新生儿疾病筛查或具备助产资质的医疗卫生机构也同步成立了新生儿疾病筛查工作领导小组，坚持一把手负总责，分管领导亲自抓，落实专人具体负责，建立和完善新生儿疾病筛查工作制度和实施方案，按照全县统一要求落实职责，共同抓好新生儿疾病筛查工作。
二是明确工作职责。县卫生计生局负责全县新生儿疾病筛查、听力筛查监督指导、协调、考核等工作；各镇（街）党委、政府指导计生办负责辖区新生儿疾病筛查、听力筛查的组织、宣传教育、随访服务、督促参加筛查等工作；县妇幼保健计划生育服务中心负责全县新生儿疾病筛查管理、血片采集、实验室检测、诊治及数据统计、上报工作，负责全县新生儿听力筛查初、复筛工作，协助市妇幼保健院做好新生儿疾病筛查可疑阳性患儿的召回、复查工作；各助产医疗机构负责新生儿疾病筛查工作的宣传教育、督促工作，配合县妇幼保健计划生育服务中心做好新生儿听力筛查、新生儿血片采集、患病儿童随访等服务工作，按照县妇幼保健计划生育服务中心要求做好本单位数据统计、信息上报及宣传教育、随访服务工作；各基层医疗卫生机构负责新生儿访视，统计县外分娩新生儿信息，将新生儿信息及时报县妇幼保健计划生育服务中心，并督促所有未参加新生儿疾病筛查、听力筛查的及时参加筛查。
三是严格考核奖惩。县卫生计生局实行每月通报制度，每月通报各镇（街）、医疗卫生机构新生儿疾病筛查工作进展情况、宣传教育、电话随访情况。严格考核，加大新生儿疾病筛查工作在人口目标和卫生计生综合考核中的分值权重，及时统计进展情况，计入年终总成绩。实行加分奖励，对镇（街）组织参加市串联质谱技术筛查的，按例进行加分；严格奖惩，对连续两个月开展工作不力、指标完成不好的，对主要负责同志进行约谈；对连续三个月以上完不成指标，取消所在单位年终授奖资格；对年度工作严重滞后、问题严重、影响全县成绩的，给予黄牌警告或重点管理，落实“一票否决”。