症状：果实受害从心室开始，逐渐向外扩展霉烂。病果果心变褐，充满灰绿色的霉状物，有时为粉红色霉状物。在贮藏过程中，当果心霉烂发展严重时，果实胴部可见水渍状、褐色、形状不规则的湿腐斑块，斑块可彼此相联成片，最后全果腐烂，果肉味苦。
病果在树上有果面发黄、未成熟失绿、果形不正或着色较早的现象，但一般症状不明显，不易发现。此外，病菌的侵染还会引起幼果的大量脱落，导致减产。
据调查：苹果霉心病的症状在田间有三种表现类型，即褐变型、霉心型和腐烂型。三种类型所占比例分别为42%，28%，30%。
1.褐变型主要是心室发生褐变；
2.霉心型主要特点是心室发霉，在心室内产生绿、灰白、灰黑、粉红等颜色的霉状物，只限于心室，病变不突破心室壁，基本不影响果实的食用；
3.腐烂型主要特点是导致果心区果肉从心室向外腐烂，严重时可烂透，直到果实表面，腐烂果肉味苦。
这三种症状类型在田间发生的时间不同。在果实生长早期，霉心病以褐变型出现最多，但是在落果中发现霉心病的果实心室内有粉红色粉状物，而且果柄中心已经褐色腐烂；在苹果成熟期和贮藏期，霉心病以腐烂型为主，切开苹果可以看到心室组织和部分果肉已腐烂。